По версии обвинения, в конце 1990 года Язов поручил подготовить план возвращения Литвы в состав СССР и составить список стратегических объектов, подлежащих захвату. В результате реализации его плана в январе 1991 года «началась агрессия со стороны Советского Союза и вооруженный конфликт в Литве».
По делу также заочно осужден бывший офицер КГБ Михаил Головатов; он получил 12 лет тюрьмы. Всего обвинения в «осуществленной советской агрессии» против Литвы предъявлены 67 гражданам России, Белоруссии и Украины. Перед судом предстали лишь два гражданина РФ, остальные привлечены к суду заочно.