Проект, который уже значительно вышел за рамки первоначального бюджета и отстает от графика, подвергается дополнительному финансовому давлению. В Министерстве сообщения объяснили, что повышение налоговых ставок на песок, гравий и торф приведет к новым расходам при строительстве железнодорожной инфраструктуры.
Представители министерства сообщили, что точные расчеты пока не завершены, однако ожидаемые суммы оцениваются как значительные. Попытка добиться освобождения Rail Baltica от данного налога также не получила поддержки. При этом в Министерстве финансов и Министерстве климата и энергетики признали, что влияние изменений налоговой политики на стоимость проекта не анализировалось.
Ситуация вызвала критические оценки со стороны депутатов Сейма. Так, Андрис Кулбергс, ранее возглавлявший парламентскую комиссию по расследованию хода проекта, заявил, что государство одновременно ищет пути сокращения расходов и увеличивает затраты за счет удорожания строительных материалов. Он также обратил внимание на отсутствие качественной координации между государственными структурами, назвав это давней системной проблемой проекта.
Одним из примеров эксперты называют рост стоимости строительства двухуровневого моста почти в четыре раза. На данный объект уже выделено около 50 миллионов евро из фонда военной мобильности, однако из-за пересмотра технических решений возник риск утраты части этих средств. А. Кулбергс напомнил, что планирование маршрута, затрагивающего 200-километровый участок, согласовывалось с 63 самоуправлениями, каждое из которых выдвигало собственные требования, порой не учитывающие экономические реалии.
Бывший министр сообщения Каспар Бришкенс указал, что высокая стоимость отдельных этапов строительства изначально была очевидна. По его словам, географические особенности Латвии обусловливают значительные затраты, а переход через Даугаву всегда рассматривался как один из наиболее дорогих элементов.
Министерство сообщения ведет переговоры с Европейской комиссией о продлении сроков освоения выделенных средств и корректировке технических решений, чтобы минимизировать возможные потери финансирования. Конкретные договоренности пока не достигнуты.